Здравствуйте, Евгения.
Вероятно, что это техническая ошибка. Вам должны были вернуть полную стоимость билетов, так как Вы отменили билеты из-за задержки поезда и в связи с предложением ж/д компании отменить билеты бесплатно по этой причине. Рекомендуем обратиться в ж/д компанию Renfe для оперативного решения вопроса.